Centro de Ciências Computacionais
Rio Grande, 26 de abril de 2024
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Defesa de Projeto de Conclusão de Curso em Engenharia de Computação

 

Aluno: EGLEN DA VEIGA PROTAS 

 

Data/Hora: 13/01/2015 as 13:30

Local: Auditorio C3

 

Título: Paralelização do cálculo de escores Bayesianos para a inferência de grafos

 

Resumo: .

 Um problema importante na área da biologia sistêmica é a inferência de redes regulatórias utilizando dados pós-genômicos. O aumento recente na disponibilidade de tais dados estimulou o interesse em inferir as redes utilizando apenas os dados.

Redes regulatórias podem ser representadas através de Redes Bayesianas. É possível inferir uma Rede Bayesiana que representa uma rede regulatória utilizando um conjunto de dados pós-genômicos através do algoritmo Markov Chain Monte Carlo. Esse processo,

porém, requer um grande número de iterações do algoritmo e demora muito tempo para convergir, o que limita o tamanho das redes que podem ser inferidas na prática. O objetivo desse trabalho é reduzir o tempo de execução do Markov Chain Monte Carlo através da

aplicação de técnicas de computação paralela no  cálculo do escore da rede, uma operação complexa que é responsável por grande parte do tempo de execução do Markov Chain Monte Carlo.

 

 

Banca:

Prof. Dr. Adriano Velasque Werhli (orientador)

Prof. Msc. Pedro de Botelho Marcos (coorientador)

Profa. Dra. Karina dos Santos Machado

Prof. Dr. Vagner Santos da Rosa







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